В 1999 году государством в целях защиты вкладов населения в банках второго уровня был создан Фонд гарантирования депозитов (ФГД). В Казахстане любой банк, который получает лицензию на прием депозитов, ведение и открытие банковских счетов физических лиц, обязан вступить в систему гарантирования депозитов. В случае принудительной ликвидации одного из этих банков-участников ФГД гарантированно выплачивает возмещение вкладчикам банка, который был подвергнут ликвидации.

В фонде сформирован специальный резерв для гарантированного возмещения депозитов. Резерв пополняется за счет обязательных взносов всех банков, работающих на территории республики. С 1999 года по 2008-й максимальная сумма  гарантированной выплаты составляла 700 тысяч тенге. Уже в феврале 2008 года максимальный размер гарантии повысили до 5 миллионов тенге. Эта мера была принята государством для защиты казахстанцев на период кризиса и должна была действовать до 1 января 2012 года. Однако 28 декабря 2011 года президент Казахстана подписал поправки к закону, которые предусматривают  сохранение гарантированной суммы возмещения в 5 миллионов тенге на постоянной основе.

Эксперты отмечают, что  гарантированию подлежат не только депозиты вкладчиков, то есть срочный вклад, до востребования, условные депозиты, но и текущие, карточные счета, физических лиц и индивидуальных предпринимателей.